复旦大学王牌专业主要有哲学、理论经济学、政治学、中国史、数学、马克思主义理论、中国语言文学、新闻传播学、物理学、化学、工商管理、临床医学、基础医学等。
复旦大学国家重点学科序 号一级学科二级学科1哲学产业经济学金融学2理论经济学政治学理论国际关系3中国语言文学历史地理学中国近现代史4新闻传播学计算机软件与理论内科学心血管病5数学肾病传染病6物理学儿科学神经病学7化学影像医学与核医学外科学8生物学眼科学耳鼻咽喉科学9电子科学与技术肿瘤学妇产科学10基础医学流行病学与卫生统计学药剂学11中西医结合社会医学与卫生事业管理复旦大学第四轮学科评估结果
在此次学科评估中，复旦大学共有38个学科参评， 获批A类（A+、A、A-）学科23个，占参评学科数60.5%。
复旦大学A+学科5个，包括哲学、理论经济学、政治学、中国史、数学；A学科8个，包括马克思主义理论、中国语言文学、新闻传播学、物理学、化学、工商管理、临床医学、基础医学；A-学科10个，包括：应用经济学、社会学、外国语言文学、生物学、生态学、电子科学与技术、公共卫生与预防医学、公共管理、药学、中西医结合。
