分子力场,Molecular force field
1)Molecular force field分子力场
1.Molecular force field (also known as molecular mechanics) method is “a calculational method to give accurate structures and energies for molecules" (Allinger).最初的分子力场都是针对某一特定体系的 ,它们的许多参数要由观测数据拟合得到。
2.The computational software in the fields of computational chemistry and materials science,and the molecular force fields which have been employed in polymer systems,were presented.介绍了用于计算化学和材料科学领域的计算软件,以及可用于高分子体系的分子力场。
3.In this paper,the principle of molecular dynamics(MD),and the category of molecular force field,and the establishment of AMBER、OPLS and CHARMM force field are introduced.本文介绍了分子动力学(molecular dynamics,MD)的基本原理,分子力场的种类,以及离子液体分子动力学模拟一般采用的AMBER、OPLS和CHARMM三种力场的构建形式。
英文短句/例句
1.Force Field Development and Predictions of Thermodynamic Properties for Aldehydes and Ketones醛酮类化合物的分子力场参数推导及热力学性质计算
2.Force field development and prediction of thermodynamic properties for alkenes烯烃类分子的分子力学力场及热力学性质预测
3.Force Field Development and Application of Coarse-Grained Molecular Dynamics粗粒化分子动力学—力场开发与应用
putation and Haptic Application of Protein Interaction Fields Based on CHARMM Force Field基于CHARMM力场的蛋白质分子场计算及触觉感知
5.Semiclassical Theory of Atomic and Molecular Dynamics in Strong External Fields;强外场中原子、分子动力学的半经典理论研究
6.Discussion on Velocity Distribution Law of Gas Molecular with the Effect of External Force Field;对外力场作用下气体分子速度分布规律的讨论
7.Analysis and Calculation of Stator end Region Magnetic Field in Powerformer电力发生器定子端部磁场的分析与计算
8.Analyzing Firepower Application of Non-Terminal-Correction Cluster Warhead for Damaging Aerodrome Runway;无末修子母弹突击机场跑道火力运用分析
9.Application Analysis of Loss Factor Method in East China Power Market;网损因子法在华东区域电力市场的应用分析
10.The Influence of Temperature on the Distribution Law of Particles with Altitude in Gravitatinal Field;温度对重力场中粒子数按高度分布律的影响
11.The Free Propagator of the Graviton Field Using Feynman Integral利用费曼积分计算引力场的自由传播子
12.Calculation Method of Q Resolution Function of Small-angle Neutron Scattering in Gravity Field重力场中子小角散射Q分辨函数计算方法
13.Molecular dynamics simulation of the ethanol clusters under the external magnetic field外磁场作用下乙醇团簇的分子动力学模拟
14.Chinese ICT Industries" Global Market Power:an Empirical Analysis我国电子信息业的国际市场势力:一个实证分析
15.The affection to water clusters on temperatures and electric fields by molecular dynamics simulation温度和外加电场对水分子团簇影响的分子动力学模拟
16.Magnetic and high-frequency electromagnetic field analysis in neutralizer of electron cyclotron resonance thruster电子回旋共振推力器中和器内磁场与微波电磁场计算分析
17.Magnetic and High-frequency Electromagnetic Field Analysis in Electron Cyclotron Resonance Thruster电子回旋共振推力器放电室内磁场与微波电磁场分析
18.Photoionization and Photodissociation Dynamics of the Diatomic Molecule in the Strong Femtosecond Laser Fields;飞秒强激光场中双原子分子电离与解离动力学研究
相关短句/例句
molecular mechanics分子力场
3)force field分子力场
1.PCFF and COMPASSforce fields were used to describe PDMS and PS1 polymeric systems and to estimate the diffusion coefficient of N2 and O2 through the PDMS and PS1 matrices at 298 K by molecular dynamics simulation.选择PCFF和COMPASS分子力场对橡胶态聚合物PDMS和玻璃态聚合物PS1体系进行模拟。
4)molecular field analysis(MFA)分子力场分析
1.Jarvis-Patrick clustering method coupled with principal component analysis(PCA) and then the quantitative structure-activity relationships(QSAR) were investigated using genetic function approximation(GFA) and molecular field analysis(MFA),respectively.Jarvis-Patrick聚类方法对新型含噻唑和三唑环的亚胺类杂环化合物进行分类,再用遗传函数算法(GFA)和分子力场分析方法(MFA)分别进行了二维/三维定量构效关系研究(QSAR),所建模型都通过了显著性检验,CV-r2均大于0。
5)CoMFA比较分子力场
1.Studies on quantitative structure activity relationship (QSAR) withCoMFA for the bioactivities of a series of sulfonamide hydroxamic acid HDAC inhibitors were carried out successfully,and a good cross validated correlation (q2=0.应用比较分子力场(CoMFA)法对一系列磺胺基羟肟酸类HDAC抑制剂进行了结构活性关系研究,得到的模型具有较高的交叉验证系数(q2=0。
2.A 3D-QSAR model was obtained by using comparative molecular field analysis (CoMFA) on a series of de- rivatives N-substituted-glycyl-2-cyanopyrrolidine with highly potent and selective inhibition for dipeptidyl peptidase IV.我们使用比较分子力场分析方法建立DPP-IV 抑制剂——N-取代的甘氨酰氰基吡咯衍生物的三维定量构效关系, 该模型为设计用于治疗II 型糖尿病的高效DPP-IV抑制剂提供结构信息。
3.3D-QSAR of 34 N-(3-phenylpropyl) piperazine type of σ1 receptor ligands was performed with comparative molecular fields analysis(CoMFA) and comparative molecular similarity index analysis(CoMSIA).采用比较分子力场(CoMFA)分析法和比较分子相似性指数(CoMSIA)分析法,对34个N-(3-苯丙基)哌嗪类σ1受体配体进行三维定量构效关系(3D-QSAR)研究,建立了具有较强预测能力的3D-QSAR模型。
6)CoMFA比较分子力场法
1.It is our aim to establish theCoMFA models of the ent-kauranoids from Isodon xerophilus and guide the design for new anti-cancer drugs.应用比较分子力场法(COMFA)研究了一系列旱生香茶菜二萜化合物对人红细胞白血病(K562)、人早幼粒白血病(HL60)、人胃腺癌(MKN28)和人结肠癌(HCT)细胞体外抗肿瘤活性进行了三维定量构效关系的初步研究,其结果将为香茶菜二萜的结构修饰和简化,先导化合物的发现提供理论依据。
延伸阅读
分子力场
PCMODEL，一个基于分子力学的计算软件
分子力场根据量子力学的波恩-奥本海默近似，一个分子的能量可以近似看作构成分子的各个原子的空间坐标的函数，简单地讲就是分子的能量随分子构型的变化而变化，而描述这种分子能量和分子结构之间关系的就是分子力场函数。分子力场函数为来自实验结果的经验公式，可以讲对分子能量的模拟比较粗糙，但是相比于精确的量子力学从头计算方法，分子力场方法的计算量要小数十倍，而且在适当的范围内，分子力场方法的计算精度与量子化学计算相差无几，因此对大分子复杂体系而言，分子力场方法是一套行之有效的方法。以分子力场为基础的分子力学计算方法在分子动力学、蒙特卡罗方法、分子对接等分子模拟方法中有着广泛的应用。[编辑]构成一般而言，分子力场函数由以下几个部分构成：键伸缩能：构成分子的各个化学键在键轴方向上的伸缩运动所引起的能量变化键角弯曲能：键角变化引起的分子能量变化二面角扭曲能：单键旋转引起分子骨架扭曲所产生的能量变化非键相互作用：包括范德华力、静电相互作用等与能量有关的非键相互作用交叉能量项：上述作用之间耦合引起的能量变化构成一套力场函数体系需要有一套联系分子能量和构型的函数，还需要给出各种不同原子在不同成键状况下的物理参数，比如正常的键长、键角、二面角等，这些力场参数多来自实验或者量子化学计算。[编辑]常用力场函数和分类不同的分子力场会选取不同的函数形式来描述上述能量与体系构型之间的关系。到目前，不同的科研团队设计了很多适用于不同体系的力场函数，根据他们选择的函数和力场参数，可以分为以下几类传统力场AMBER力场：由Kollman课题组开发的力场，是目前使用比较广泛的一种力场，适合处理生物大分子。CHARMM力场：由Karplus课题组开发，对小分子体系到溶剂化的大分子体系都有很好的拟合。CVFF力场：CVFF力场是一个可以用于无机体系计算的力场MMX力场：MMX力场包括MM2和MM3，是目前应用最为广泛的一种力场，主要针对有机小分子第二代力场
- 第二代的势能函数形式比传统力场要更加复杂，涉及的力场参数更多，计算量也更大，当然也相应地更加准确。
- 通用力场也叫基于规则的力场，它所应用的力场参数是基于原子性质计算所得，用户可以通过自主设定一系列分子作为训练集来生成合用的力场参数
