相比目前其他期刊发表的关于新冠病毒的科研报告，本次发布在《柳叶刀》的论文相对权威。
论文作者们也就此次疫情在文章的最后再次强调了野生动物体内未知病毒对人类的潜在威胁。
在第一篇研究报告中，科学家从9名被确诊为新冠肺炎患者的支气管肺泡灌洗液与培养物中分离出了样本，进行基因测序和遗传分析工作。
研究人员们首先比对了它们之间的基因序列。比对结果表明，8个完整的病毒基因组高达99.98%，几乎完全一致。
事实上，经过科研人员以及医生的询问，在这9名确诊新冠肺炎病例当中，有8名患者去过华南海鲜市场，另外一名患者从未去过华南海鲜市场，但在并发之前就住在市场附近的一家旅馆里，如何感染病毒尚不明确。
根据数据以及病患叙述，这个比对结果表明，不管新冠肺炎的疫源地在哪里，病毒源头都是一致的。而且可以确定，新型冠状病毒就起源于一个来源，这中间相隔的时间极短，并且可以被相对迅速地检测到。
那么，这些病毒从何而来呢？
该论文表示，科研人员将新型冠状病毒基因序列与现有病毒库进行比较，这也包括了知名的SARS病毒和MERS病毒。比对结果表明，两种分离出的病毒bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21，它们共享87.99%的病毒基因序列。
也就是说， 与新型冠状病毒完整基因组序列最为接近的，是科学家在浙江省舟山市的蝙蝠体内分离出的两株病毒，它们的相似性达到88左右。
相比之下，新型冠状病毒与SARS和MERS病毒的序列就没那么相像，相似性分别为79%和50%。这也同时证实了，尽管新冠肺炎与SARS的病毒的源头都为蝙蝠，且有相似的结构。
但从数据上看，两次的冠状病毒样本并不一致，也就是说，武汉肺炎疫情的病毒是一种未知的、不同于SARS冠状病毒和MERS冠状病毒的新型冠状病毒。
根据论文当中的数据分析，造成武汉爆发疫情的新型冠状病毒，可能是浙江舟山蝙蝠所衍生出来的，并通过在华南海鲜市场出售的一种目前未知野生动物，再传播给人类。
而蝙蝠冠状病毒较易突变，才让新型冠状病毒的源头不太好判断，如果发现了更密切相关的动物病毒，则可以对中间宿主进行解析。
另外，中科院武汉病毒研究所的石正丽团队曾在未审议学术平台bioRxiv上发文称，从一种蝙蝠冠状病毒BatCoV RaTG13中发现了一个短的RdRp区域，这种病毒是在蝙蝠体内检测到的，该区域显示了对新型冠状病毒的高序列同源性，全基因组序列同源性为96.2%。
系统发育分析还表明，RaTG13是新型冠状病毒的近亲，也就是说，石正丽团队认为，蝙蝠病毒是新型冠状病毒的源头。
两份研究报告，为新型冠状病毒的“蝙蝠起源”提供了更多证据。
“这些数据与一般用于冠状病毒的蝙蝠库一致，特别是与新型冠状病毒一致。然而，尽管蝙蝠很重要，但似乎其他动物宿主正在充当蝙蝠与人类之间的中间宿主。”武桂珍对该论文解释称。
“首先，爆发是在12月下旬报道的，当时武汉的大多数蝙蝠种类都在冬眠。其次，在华南海鲜市场上没有出售或发现蝙蝠，而许多非水生动物的遗传序列相似度不到90％，这意味着华南海鲜市场不是第一宿主来源，在SARS和MERS中，蝙蝠都是源头，另一只动物是中间宿主，人类是终末宿主，这再次凸显了野生动物中隐藏的病毒库以及它们潜伏到哺乳动物（人）体内的潜力。”
