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Ubuntu18.04+RTX 2080Ti+CUDA 10.0 +cuDNN+PyTorch搭建深度学习环境

时间:2021-05-19 03:36:51

相关推荐

Ubuntu18.04+RTX 2080Ti+CUDA 10.0 +cuDNN+PyTorch搭建深度学习环境

SSH无密码登陆

安装SSH Server

Ubuntu 默认已安装了 SSH client,此外还需要安装 SSH server:

sudo apt-get install openssh-server

登陆本机

ssh localhost

此时会有如下提示(SSH首次登陆提示),输入 yes 。然后按提示输入密码 ,但这样登陆是需要每次输入密码的,我们需要配置成SSH无密码登陆比较方便。

SSH 无密码登陆

首先退出刚才的 ssh,回到了我们原先的终端窗口,然后利用 ssh-keygen 生成密钥,并将密钥加入到授权中:

exit # 退出刚才的 ssh localhost

cd ~/.ssh/ # 若没有该目录,请先执行一次ssh localhost

ssh-keygen -t rsa # 会有提示,都按回车就可以

cat ./id_rsa.pub >> ./authorized_keys # 加入授权

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此时再用 ssh localhost 命令,无需输入密码就可以直接登陆了

安装驱动

linux安装NVIDIA显卡驱动

驱动下载地址 ,下载时切记选择.run版本,我们下载的版本是NVIDIA Linux-x86_64-430.40.run

安装驱动之前要安装其他需要的依赖工具:

sudo apt-get install gcc g++ make

检测驱动是否成功安装

方法1:使用nvidia-smi命令测试

英伟达系统管理接口(NVIDIA System Management Interface, 简称 nvidia-smi)是基于NVIDIA Management Library (NVML) 的命令行管理组件,旨在(intened to )帮助管理和监控NVIDIA GPU设备。

在终端输入命令nvidia-smi

方法2:使用nvidia-settings命令

在终端输入命令nvidia-settings

会调出NVIDIA的驱动管理程序:

如果打开的页面能够看到驱动的版本号,如本案例所示为430.40,则nvidia-setting安装正常。

搭建深度学习环境

CUDA 10.0安装

进入CUDA toolkit download官网之后会显示CUDA最新版本,这个时候先别急着选系统和下载文件类型,先看一下下什么样的CUDA版本能够跟PyTorch适配。

进入PyTorch官网

我们能看到可选择的CUDA版本只有9.2和10.0,因此我们去CUDA官网下载10.0版本

CUDA toolkit起始界面

选择适配的CUDA版本

打开显示的是最新的10.1 版本,这里我们选择“Legacy Releases”查看之前发布的版本,并如下图所示选择“CUDA Toolkit 10.0”版本

定制化下载CUDA 10.0

安装CUDA

sudo sh cuda_10.0.130_410.48_linux.run

然后会出现很长的协议书,一直按到最后出现如下需要用户选择的界面:

之后,按照提示安装即可。我依次选择了:

1 accept #同意安装

2 n #不安装Driver,因为已安装最新驱动

3 y #安装CUDA Toolkit

4 <Enter> #安装到默认目录

5 y #创建安装目录的软链接

6 y #复制Samples一份到家目录

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安装完成界面(由于我们没有选择安装driver,因此会显示不完全安装,但是CUDA toolkit都已成功安装就可以了):

以及安装过程中有CUDA location:

在本例中cuda被安装到的路径为/usr/local/cuda-10.0

更改环境变量、创建动态链接库并创建链接文件

声明环境变量

$ sudo vim ~/.bashrc

在文件(在用户目录下)的尾部,输入内容如下:

export PATH=/usr/local/cuda-10.0/bin${PATH:+:$PATH}}

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-10.0/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}

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保存退出,并输入下面指令使环境变量立刻生效:

$ source ~/.bashrc

设置环境变量和动态链接库

$ sudo vim /etc/profile

在打开的文件末尾加入:

export PATH=/usr/local/cuda/bin:$PATH

创建链接文件

$ sudo vim /etc/ld.so.conf.d/cuda.conf

在打开的文件中添加如下语句:

/usr/local/cuda/lib64

保存退出,然后执行

$ sudo ldconfig使链接立即生效。

检查CUDA是否安装成功

nvcc --version

CUDA Sample测试

切换到 CUDA 10.0 Samples 默认安装路径(即在/home/用户/NVIDIA_CUDA-9.1_Samples 目录下), 终端下输入:

$ cd NVIDIA_CUDA-10.0_Samples

$ sudo make all -j4

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查看CUDA 驱动和CUDA toolkit版本

$ cd bin/x86_64/linux/release

$ ./deviceQuery

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Q:这个时候存在一个问题 如果CUDA驱动比CUDA版本要高 是否可以支持?

安装cuDNN

先在NVIDIA官网注册用户名和密码,然后进入cuDNN下载页面,需要与BUDA10.0环境适配,因此我们选择下载以下几项来安装:

首先解压tgz包

tar -zxvf cudnn-10.0-linux-x64-v7.6.2.24.tgz

复制文件到cuda环境

sudo cp cuda/include/cudnn.h /usr/local/cuda/include

sudo cp cuda/lib64/libcudnn* /usr/local/cuda/lib64

sudo chmod a+r /usr/local/cuda/include/cudnn.h /usr/local/cuda/lib64/libcudnn*

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安装deb包

sudo dpkg -i libcudnn7_7.6.2.24-1+cuda10.0_amd64.deb

sudo dpkg -i libcudnn7-dev_7.6.2.24-1+cuda10.0_amd64.deb

sudo dpkg -i libcudnn7-doc_7.6.2.24-1+cuda10.0_amd64.deb

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测试是否安装成功

cp -r /usr/src/cudnn_samples_v7/ ~

cd ~/cudnn_samples_v7/mnistCUDNN

make clean && make

./mnistCUDNN

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显示“Test passed!”即测试通过!

安装Python、Anaconda和Pip

Python

下载python 3.7.2 源程序压缩包

$ sudo wget /ftp/python/3.7.2/Python-3.7.2.tgz

解压

$ tar -xzvf Python-3.7.2.tgz

配置

$ cd Python-3.7.1

$ ./configure --enable-optimizations

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执行上述语句将启用代码的发布版本,可以优化二进制文件以更好的更快的运行,但是需要运行测试,编译时需要花费一些时间(大约半小时),也可以不进行这一项配置。

编译和安装Python 3.7.2

$ sudo make

$ sudo make install

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Debugging

在执行$ sudo make install时出错

出现的问题

“zipimport.ZipImportError: can’t decompress data; zlib not available Makefile:1130: recipe for target ‘install’ failed make: *** [install] Error 1“

解决方案

安装zlib1g-dev

$ sudo apt install zlib1g-dev

出现第二个问题

“ModuleNotFoundError: No module named ‘_ctypes’

Makefile:1130: recipe for target ‘install’ failed

make: *** [install] Error 1”

解决方案

$ sudo apt-get install --reinstall zlibc zlib1g zlib1g-dev

$ sudo apt-get install libffi-dev libssl-dev libreadline-dev -y

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然后重新执行$ sudo make install,显示:

查看Python版本

$ python --version

Anaconda

Method 1 参考Anaconda快速安装攻略

由于在官网下载非常慢,并且经常网络断掉,因此最好在清华大学开源软件镜像站中下载,具体下载链接 ,在该页面滑倒最后可以下载最新版本。本案例选择下载Anaconda3-5.2.0-Linux-x86_64.sh版本。

进入下载文件的位置

$ cd Downloads/

运行.sh文件:

$ bash Anaconda3-5.2.0-Linux-x86_64.sh

进入注册信息页面,输入’yes’

安装过程中会提示

Anaconda3 will now be installed into this location:

/home/silver/anaconda3

Press ENTER to confirm the location

Press CTRL-C to abort the installation

Or specify a different location below

我们不更改安装路径的话继续输入

出现如下界面则说明anaconda成功安装,这里询问是否需要安装VScode,一般不需要的话就输入"no"

将anaconda加入系统环境变量

sudo vim ~/.bashrc

加入:

export PATH=/home/silver/anaconda3/bin:$PATH

在终端中输入

conda info

即可查看详细信息

如何启动Anaconda图形化界面

$ source ~/anaconda3/bin/activate root

$ anaconda-navigator

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Method n(官网下载非常慢 不推荐!) 进入Anaconda官网下载页面

下载相应版本安装即可:

sudo sh Anaconda3-.07-Linux-x86_64.sh

安装PyTorch

进入PyTorch官网,根据自己的环境来定制化选择PyTorch下载安装版本,选好之后复制下方的命令行:

conda install pytorch torchvision cudatoolkit=10.0 -c pytorch

下载完成提示:

安装Tensorflow

首先安装NVIDIA必要组件:

$ sudo apt-get install libcupti-dev

先确保linux上pip可用

$ sudo apt-get install python3-pip python3-dev # for Python 3.x

然后用pip3(针对python3.x版本)安装gpu版本的TensorFlow

$ pip3 install tensorflow-gpu

安装过程中遇到了两个错误提示:

ERROR1:

ERROR: 1.14.0 has requirement setuptools>=41.0.0, but you’ll have setuptools 39.1.0 which is incompatible.

出错原因:setuptools 版本太低

解决方案:更新setuptools版本 输入:

pip install --upgrade setuptools

命令执行结果:

ERROR1:

ERROR: Cannot uninstall ‘wrapt’. It is a distutils installed project and thus we cannot accurately determine which files belong to it which would lead to only a partial uninstall.

出错原因:不能够卸载’wrapt’,因为我们不能准确判断它归属于哪个文件,这将会导致部分卸载

解决方案:输入

pip install -U --ignore-installed wrapt enum34 simplejson netaddr

命令执行结果:

此时再重新执行$ pip3 install tensorflow-gpu

当我们解决完各组件的安装问题后,即可成功安装tensorflow,安装成功界面如下:

检测tensorflow是否安装成功并查看版本号

import tensorflow as tf

print(tf.__version__) ##两条下划线

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在VS Code中运行一个Tensorflow程序

案例来自斯坦福大学NLP课程 cs224n Lecture7 参考链接

程序执行之前需要安装numpy包

import tensorflow as tf

import numpy as np

# create data

x_data = np.random.rand(100).astype(np.float32) # 随机生成100个随机数列

y_data = x_data*0.1+0.3

###Create tensorflow structure start###

Weights = tf.Variable(tf.random_uniform([1],-1.0,1.0)) # W大写代表可能是权重矩阵,里面的参数分>别是[1] 代表1维矩阵 ,生成随机数范围指定从-1.0到1.0

biases = tf.Variable(tf.zeros([1]))

y = Weights * x_data + biases

loss = tf.reduce_mean(tf.square(y-y_data))

optimizer = tf.train.GradientDescentOptimizer(0.5) # 0.5代表学习率

train = optimizer.minimize(loss) #训练的过程就是不断在最小化损失函数的过程

# deprecated

# init = tf.initialize_all_variables()

init = tf.global_variables_initializer()

###Create tensorflow structure end###

sess = tf.Session()

sess.run(init)

for step in range(201):

sess.run(train)

if step % 20 == 0:

print(step,sess.run(Weights),sess.run(biases))

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终端输出结果

我们在终端执行结果界面可以看到程序已经运行在RTX 2080 Ti上,GPU提供7.5的算力。

至此,深度学习环境搭建完成!![撒花]

今天也是一个爱(有)学(耐)习(心)的女孩纸呢嘻嘻~

Reference

linux安装NVIDIA显卡驱动

ubuntu18.04安装2080ti教程

多显卡驱动踩坑记

​ 我在安装NVIDIA驱动时也遇到过突然系统重启进入TUI(文本命令行界面),如果想要进入图形界面需要Ctrl+Alt+F1,或者TUI界面下,Ctrl+Alt+F1+F2一起按一定能进入图形界面。

安装CUDA_配置环境变量

Ubuntu 18.04 安装 python3.7

Python3.7安装:ModuleNotFoundError: No module named ‘_ctypes’

Anaconda快速安装攻略

cuDNN安装测试

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版权声明:本文为CSDN博主「不一样的雅兰酱」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。

原文链接:/silver1225/article/details/100393719

注意tensorflow-gpu-2.0有几处代码改动,在跑faster-rcnn的时候有点问题,所以后面需要把tensorflow-gpu版本改成1.1+的。

我这里的环境是:

Ubuntu16.04+2080ti+Display Driver430.50+cuda10.0+cudnn7+Anaconda(python3.6)+tensorflow-gpu-1.13.1

1. 显卡驱动: 版本430.50,有不同的安装格式,这里我下的是runfile。

安装显卡驱动步骤:

(1)lsmod |grep nouveau,查看到源生的驱动在。如果有就是会出现红色的nouveau,没有就什么都没有。

(2)如果有原生的驱动在,需要禁用自带的 nouveau nvidia驱动 (important!)

-->创建一个文件通过命令 sudo vim /etc/modprobe.d/blacklist-nouveau.conf

--> 按一下 i 进入编辑状态,并添加如下内容:

blacklist nouveau

options nouveau modeset=0

编辑完了:esc--> :-->wq! (保存并退出)

-->再更新一下

sudo update-initramfs -u

-->修改后需要重启系统。确认下Nouveau是已经被你干掉,使用命令: lsmod | grep nouveau

(3)禁掉lightdm桌面管理器,安装驱动(secure boot disabled)

sudo /etc/init.d/lightdm stop

接下来会变黑好像什么都没有,这时候ctrl+alt+f1(命令行出来了)

(4)然后找到你放run文件的文件夹下:

sudo sh ./NVIDIA-Linux-x86_64-375.20.run –no-opengl-files(这个参数不知道什么用,别人说有用我就加了)

(5)然后这样:sudo /etc/init.d/lightdm start,就可以进入正常的界面了。

安装好了可以查看显卡驱动版本:cat /proc/driver/nvidia/version

2. 安装CUDA10.0

2080ti 似乎和cuda9有问题,再装了cudnn之后跑cudnn_samples报错,后面改成了cuda10之后就成功了。

1)下载cuda:/cuda-toolkit-archive , 我用的是10.0.

cuda安装参考: /p/47330858

2)安装之前验证一下电脑是否已经插上了支持CUDA的GPU,用win+alt+t调出终端,然后输入:

lspci | grep -i nvidia

如果显示出你的NVIDIA GPU版本信息应该就没问题。

3)验证系统是否安装了gcc,在终端中输入:

gcc --version

如果装了结果会显示类似信息:

gcc (Ubuntu 5.4.0-6ubuntu1~16.04.5) 5.4.0

如果没有就自行安装。sudo apt-get install build-essential (Ubuntu默认gcc5.4)

4)验证系统是否安装了kernel header和 package development

a、查看正在运行的系统内核版本:

在终端中输入:

uname --r

结果显示类似就可以:4.10.0-40-generic

b、在终端中输入:

sudo apt-get install linux-headers-$(uname --r)

以安装对应kernel版本的kernel header和package development

结果如果显示:

升级了 0 个软件包,新安装了 0 个软件包,要卸载 0 个软件包,有 4 个软件包未被升级。

则表示系统里已经有了,不用重复安装。

5)禁用 nouveau驱动

终端中运行:

lsmod | grep nouveau

如果有输出则代表nouveau正在加载。需要我们手动禁掉nouveau。

以下是Ubuntu的nouveau禁用方法:

a、我们需要在电脑根目录的/etc/modprobe.d文件夹中创建文件blacklist-nouveau.conf

先用apt-get安装vim编辑器,然后

这需要输入命令:

sudo vi /etc/modprobe.d/blacklist-nouveau.conf

此时会出现一个窗口 (我们利用vi编辑器的指令来编辑和保存文件)

按键盘上的insert键进入输入模式,然后在文件中输入以下两行内容:

blacklist nouveau

options nouveau modeset=0

然后按ESC键退出编辑模式,在键盘上摁下“ :wq ”这三个键再回车,就保存并退出了。

b、然后在终端输入执行:

sudo update-initramfs -u

之后重启电脑

c、重启后在终端执行:

lsmod | grep nouveau

或者

lspci | grep -i nouveau

若终端无内容输出了,则禁用成功,若仍有内容输出,请检查上述操作,可以百度一下寻求解决。

注:vi是Linux终端下或控制台下常用的编辑器,要用vi打开一个文件,就输入:

vi /路径/文件名 (例如:终端输入 vi /etc/fstab 就会显示/etc/fstab文件里的内容)

基本操作:

使用键盘上的Page Up和Page Down键可以上下翻页;

按下Insert键,可以见到窗口左下角有“Insert”字样,表示当前为插入编辑状态,这时从键盘输入的内容将插入到光标位置;

再按下Insert键,左下角将有“Replace”字样,表示当前为替换编辑状态,这时从键盘输入的内容将替换光标位置的内容。

编辑完内容后,按下Esc键,并输入“:wq”,然后回车就可以保存退出。

如果不想保存而直接退出,则按下Esc键后,输入“:q!”,然后回车即可。“wq”表示Write和Quit,即保存退出;“q!”表示忽略修改强行退出。

6)重启电脑,进入登录界面的时候,不要登录进入桌面(否则可能会失败,若不小心进入,请重启电脑),直接按Ctrl+Alt+F1进入文本模式(命令行界面),然后登录账户。

登陆后输入:sudo service lightdm stop

以此来关闭图形化界面,然后切换到cuda安装文件的路径:例如我的cuda在下载文件夹里所以我要输入:

cd Downloads

然后输入(根据cuda版本不同自行修改):sudo sh cuda_10.0.130_410.48_linux.run

开始安装,按提示一步步操作,按住回车看完声明。按照提示输入相应字符,例如有的需要输入accept,有的需要输入yes。

注意:(1)遇到提示是否安装openGL ,选择no(如果你的电脑跟我一样是双显,且主显是非NVIDIA的GPU在工作,需要选择no),其他都选择yes或者默认即可。(如果您的电脑是双显卡且在这一步选择了yes,那么你极有可能安装完CUDA之后,重启图形化界面后遇到登录界面循环问题:输入密码后又跳回密码输入界面。这是因为你的电脑是双显,而且用来显示的那块GPU不是NVIDIA,则OpenGL Libraries就不应该安装,否则你正在使用的那块GPU(非NVIDIA的GPU)的OpenGL Libraries会被覆盖,然后GUI就无法工作了。)(2)要不要再装driver,记得选No。(3)另外cuda samples我也没有装。

安装成功后,会显示installed,否则会显示failed。

7)重新启动图形化界面,输入 :

sudo service lightdm start

如果没反应,需要同时按住Alt + ctrl +F7,返回到图形化登录界面,输入密码登录。

如果能够成功登录,则表示不会遇到循环登录的问题,基本说明CUDA的安装成功了。

8)重启电脑,检查Device Node Verification。

执行 ls /dev/nvidia* 可能出现a、b两种结果,请对号入座。

a、若结果显示

/dev/nvidia0 /dev/nvidiactl /dev/nvidia-uvm

------------------------这部分我没有出现-------------------------------------------------------------------

或显示出类似的信息,应该有三个(包含一个类似/dev/nvidia-nvm的),则安装成功。

b、大多数结果可能会是这样

ls: cannot access/dev/nvidia*: No such file or directory

或是这样的,只出现 /dev/nvidia0 /dev/nvidiactl

但没有/dev/nvidia-num,即文件显示不全。

我的解决方法参考了一篇博客,找到文件夹

/usr/local/cuda/samples/1_Utilities/deviceQuery,进去以后有个deviceQuery.cpp, make一下(在文件夹启动终端,输入sudo make),然后

./deviceQuery

这样你再查看

ls -la /dev | grep nvidia

就会发现有三个啦。

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8)设置环境变量

终端中输入:

sudo gedit /etc/profile

在打开的文件末尾,复制添加以下两行:

export PATH=/usr/local/cuda/bin${PATH:+:${PATH}}

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64\

${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}

(这是64位系统的,32位系统自行百度)

保存文件,并重启。因为source /etc/profile是临时生效,重启电脑才是永久生效。

到这里安装应该就成功了,后面是一些验证的工作,其实一般不用验证。

9)重启电脑,然后检查上述的环境变量是否设置成功

a、 验证驱动版本

敲入:cat /proc/driver/nvidia/version

结果显示

NVRM version: NVIDIA UNIX x86_64 Kernel Module 420

GCC version: gcc version 5.4.0 0609 (Ubuntu 5.4.0-6ubuntu1~16.04.5)

b、 验证CUDA Toolkit

敲入:nvcc -V

会输出CUDA的版本信息。

如果是这样的:

The program 'nvcc' is currently not installed. You can install it by typing:

sudo apt-get install nvidia-cuda-toolkit

可能是环境配置没有成功,请重复上述步骤8。

最后查看cuda版本:cat /usr/local/cuda/version.txt

3. 安装CUDNN

参考官网步骤:/deeplearning/sdk/cudnn-install/

Navigate to your <cudnnpath> directory containing cuDNN Debian file.

Install the runtime library, for example:

sudo dpkg -i libcudnn7_7.0.3.11-1+cuda9.0_amd64.deb

Install the developer library, for example:

sudo dpkg -i libcudnn7-devel_7.0.3.11-1+cuda9.0_amd64.deb

Install the code samples and the cuDNN Library User Guide, for example:

sudo dpkg -i libcudnn7-doc_7.0.3.11-1+cuda9.0_amd64.deb

验证前注意重启,如果装cuda9,验证的时候会出错Cublas failure,换成cuda10就好了。

4. Anaconda-python3.6

5. Tensorflow-gpu 1.13.1

pip install tensorflow-gpu==1.13.1 -i https://pypi.tuna./simple

6. 关于gcc版本:

切换gcc版本参考: /uestc-mm/p/7511063.html

改变优先级: sudo update-alternatives --install /usr/bin/gcc gcc /usr/bin/gcc-5 100 (100代表优先级)

选择可选版本:sudo update-alternatives --config gcc

查看当前gcc版本:gcc --version

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版权声明:本文为CSDN博主「竹子熊猫」的原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接及本声明。

原文链接:/summermaoz/article/details/102767889

一、硬盘分区 | Hard disk add new partition

1、显示硬盘及所属分区情况。在终端窗口中输入如下命令:

sudo fdisk -l

1.

显示当前的硬盘及所属分区的情况。如下图所示:

系统提示:DIsk /dev/sdb doesn't contain a valid partition table。

2、对硬盘进行分区。在终端窗口中输入如下命令:

sudo fdisk /dev/sdb

1.

如下图所示:

在Command (m for help)提示符后面输入m显示一个帮助菜单。

在Command (m for help)提示符后面输入n,执行 add a new partition 指令给硬盘增加一个新分区。

出现Command action时,输入e,指定分区为扩展分区(extended)。

出现Partition number(1-4)时,输入1表示只分一个区。

后续指定起启柱面(cylinder)号完成分区。

在Command (m for help)提示符后面输入p,显示分区表。

系统提示如下:

Device BootStartEndBlocksIdSystem

/dev/sdb1126108209712478+5Extended

在Command (m for help)提示符后面输入w,保存分区表。

系统提示:The partition table has been altered!

在终端窗口中输入如下命令:

sudo fdisk -l

1.

如下图所示:

系统已经识别了硬盘 /dev/sdb 的分区。

二、硬盘格式化 | Format hard disk

1、显示硬盘及所属分区情况。在终端窗口中输入如下命令:

sudo mkfs -t ext4 /dev/sdb

1.

说明:

-t ext4 表示将分区格式化成ext4文件系统类型。

三、挂载硬盘分区 | Mount hard disk partition

1、显示硬盘挂载情况。在终端窗口中输入如下命令:

df -l

1.

新硬盘分区没有挂载,无法进入和查看。

在终端窗口中输入如下命令:

sudo mount -t ext4 /dev/sdb /devdata

1.

再次在终端窗口中输入如下命令:

df -l

1.

新硬盘分区已经挂载,如下图最下面的红色方框内容。

2、配置硬盘在系统启动自动挂载。在文件 /etc/fstab 中加入如下配置:

/dev/sdb/devdata ext4defaults 0 0

1.

至此ubuntu硬盘的挂载就完成了

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